Facturation
20/5/2025
- mis à jour le
Les meilleurs logiciels de facturation en 2025

Sommaire
Avec l’entrée en vigueur imminente de la facturation électronique obligatoire en France dès 2026, toutes les entreprises – des indépendants aux PME – doivent impérativement se préparer. Ce changement majeur impose non seulement une adaptation technique, mais également une réflexion stratégique sur les outils utilisés au quotidien.
Face à cette transformation numérique, choisir un logiciel de facturation fiable, intuitif et conforme n’est plus une simple option, mais unenécessité pour rester compétitif, gagner du temps et éviter les erreurs.
Heureusement, le marché propose aujourd’hui des solutions variées, capables de répondre à tous les profils d’entreprise : automatisation des tâches, conformité fiscale, interface conviviale, intégration avec la comptabilité… Autant de critères que nous avons pris en compte pour établir cette sélection.
Découvrez dans cet article notre classement des 10 meilleurs logiciels de facturation en 2025, pour vous aider à faire un choix éclairé, sécurisé et adapté à vos besoins spécifiques.
Quels sont les meilleurs logiciels de facturation en 2025 ?
Face à la multiplication des offres sur le marché, choisir le bon logiciel de facturation peut vite devenir un casse-tête. Chaque entreprise a des besoins spécifiques : certains professionnels cherchent une solution simple et rapide pour émettre des factures, tandis que d’autres ont besoin d’un outil plus complet, intégrant par exemple la gestion de la relation client, la comptabilité ou le suivi des paiements.
Dans ce contexte, la conformité avec la réglementation sur la facturation électronique, qui deviendra obligatoire en 2026, est désormais un critère essentiel. Il ne s’agit plus seulement de gagner du temps ou d’automatiser certaines tâches, mais aussi de s’assurer que l’outil choisi respecte les normes en vigueur et anticipe les évolutions légales.
Nous avons donc sélectionné les logiciels les plus performants selon plusieurs critères : simplicité d’utilisation, richesse fonctionnelle, compatibilité avec les obligations fiscales, qualité du support technique et rapport qualité-prix. Cette sélection s’adresse aussi bien aux indépendants qu’aux TPE et PME qui souhaitent structurer leur gestion administrative avec des outils fiables et évolutifs.
Voici notre classement des meilleures solutions de facturation en 2025.
1. Sellsy
Sellsy est un logiciel français complet qui s’adresse aux petites et moyennes entreprises souhaitant centraliser l’ensemble de leur gestion commerciale et administrative sur une seule plateforme. Plus qu’un simple outil de facturation, Sellsy se positionne comme une solution intégrée qui couvre à la fois la facturation, le CRM, la gestion de trésorerie et le Marketing.
Sellsy offre une interface moderne, modulable et intuitive, permettant une prise en main rapide par les équipes administratives comme commerciales. Il est particulièrement apprécié pour sa capacité à automatiser un grand nombre de tâches chronophages, tout en offrant une vision globale de l’activité de l’entreprise. Sellsy est déjà conforme aux exigences de la législation française, et sera conforme en matière de facturation électronique.

Principales fonctionnalités :
- Création de tous types de documents : gérez votre facturation avec les bons de commande, les bons de livraison mais aussi les factures proforma.
- Transformation des devis en factures : en un clic, passez du devis à la facturation.

- Relance automatique : paramétrez des plans de relance par mail pour vos factures et devis et ne laissez plus une opportunité vous échapper.
- Pré-comptabilité : rapprochement bancaire, journaux comptables, plan comptable mais aussi export FEC pour votre expert comptable.

- Reporting : suivrez les statistiques clés de votre activité et prenez des décisions stratégiques grâce aux différents rapports.
- Paiement en ligne sécurisé, avec intégration de passerelles comme Stripe ou GoCardless.
- Signature électronique pour valider rapidement devis et contrats.
- Modules de la suite Sellsy : possibilité de connecter la facturation avec le suivi de trésorerie mais aussi toute la partie de gestion commerciale
- Intégration avec d’autres outils : Sellsy peut s’intégrer facilement avec des outils populaires comme Slack, MailChimp, et Google Drive.
- Support client réactif : accessible par mail, tchat et téléphone, basé en France.
Principaux inconvénients :
- Coût : Un essai gratuit est possible mais à l’inverse d’autres solutions, Sellsy ne propose pas de version gratuite sur le long terme.
- Complexité : En raison de la richesse de ses fonctionnalités, Sellsy peut être un peu complexe à prendre en main pour les nouveaux utilisateurs. La solution propose un accompagnement de formation pour maîtriser l’ensemble des outils.
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2. Evoliz
Evoliz est un logiciel de facturation français pensé pour les TPE et PME qui souhaitent disposer d’un outil simple, efficace et conforme à la législation fiscale. Connu pour sa clarté d’utilisation, il permet de gérer en quelques clics l’ensemble du cycle de facturation, du devis à l’encaissement, tout en offrant des fonctionnalités de suivi comptable adaptées aux petites structures.
Evoliz met l’accent sur la conformité légale, la sécurité des données (hébergées en France) et la visibilité en temps réel sur les finances de l’entreprise. Grâce à son interface intuitive et à ses tableaux de bord synthétiques, les utilisateurs peuvent suivre leur trésorerie, les paiements en attente, et générer des rapports détaillés, sans avoir besoin de compétences comptables avancées.

Principales fonctionnalités :
- Création simple et rapide de devis et factures, avec modèles conformes à la législation.
- Suivi des paiements clients, avec système de relance automatisée.
- Tableaux de bord visuels pour piloter l’activité en temps réel.
- Application mobile pour gérer la facturation en déplacement.
- Données hébergées en France, garantissant le respect des normes RGPD et fiscales.
Principaux inconvénients :
- Moins de modules complémentaires (CRM, gestion des stocks, etc.) que certaines solutions concurrentes.
- Personnalisation graphique limitée des documents (peu de liberté sur le design des factures).
3. Indy
Indy se distingue par son orientation claire vers les travailleurs indépendants, professions libérales et micro-entrepreneurs. L’un de ses atouts majeurs est sa simplicité d’utilisation : tout est pensé pour que les utilisateurs puissent gérer leur facturation et leur comptabilité sans expert-comptable.
L’approche d’Indy repose sur l’automatisation maximale des tâches administratives, notamment le calcul des charges, la génération des déclarations fiscales et la tenue comptable. En plus de la facturation, la plateforme propose un compte professionnel intégré gratuit, ce qui en fait une solution tout-en-un très appréciée pour sa praticité.

Principales fonctionnalités :
- Spécialisation pour les indépendants : Indy est conçu spécialement pour les freelances et les travailleurs indépendants, avec des fonctionnalités adaptées à leurs besoins.
- Automatisation : Le logiciel propose une automatisation des tâches comptables, ce qui permet de gagner du temps.
- Interface utilisateur conviviale : Interface simple et épurée, facile à prendre en main.
- Services : accompagnement gratuit à la création d’entreprise.
- Compte professionnel : compte dédié Indy avec carte bancaire physique et virtuelle et IBAN français.
- Offre gratuite : possibilité de commencer à utiliser la solution sans frais, sans conditions.
Principaux inconvénients :
- Moins adapté aux structures avec plusieurs salariés ou à la gestion multi-utilisateurs.
- Peu d’options de personnalisation des documents (modèles simples et peu modifiables).
4. Facture.net
Facture.net est une solution gratuite de facturation en ligne, idéale pour les auto-entrepreneurs et freelances qui ont besoin d'un outil simple pour gérer leurs devis et factures. Cette plateforme permet de créer des documents professionnels en quelques clics, tout en offrant une gestion basique des paiements.
Son interface est simple, et son modèle gratuit est une excellente option pour ceux qui démarrent leur activité ou qui n'ont pas de besoins complexes en matière de gestion administrative.

Principales fonctionnalités :
- Gratuité : Facture.net est entièrement gratuit, ce qui est un avantage significatif pour les petites entreprises et les indépendants avec un budget limité.
- Simplicité d’utilisation : Interface intuitive et facile à naviguer.
- CRM intégré : fonctionnalités basiques d’un CRM avec l’outil
- Fonctionnalités essentielles : Offre toutes les fonctionnalités de base nécessaires pour la facturation et la gestion des devis.
Principaux inconvénients :
- Pas de fonctionnalités comptables avancées.
- Interface uniquement disponible sur navigateur.
5. Henrri
Henrri est un logiciel de facturation conçu pour les freelances, auto-entrepreneurs et petites entreprises. Il se distingue par sa simplicité d’utilisation et son modèle de paiement flexible. Ce logiciel permet de gérer facilement la création de devis et de factures, tout en offrant des rappels automatiques pour les paiements en retard.
En plus de la facturation, Henrri offre une gestion complète de la trésorerie, ce qui en fait un excellent choix pour ceux qui recherchent un outil tout-en-un.

Principales fonctionnalités :
- Gratuité : Henrri est un logiciel gratuit, avec une gamme de fonctionnalités intéressantes pour les petites entreprises.
- Interface intuitive : Facile à utiliser avec une courbe d’apprentissage rapide.
- Aucune publicité : Bien que gratuit, Henrri ne contient pas de publicité, offrant une expérience utilisateur agréable.
- Évolutivité : plus de 40 modules gratuits
- Facturation complète : pas de limites de factures, de devis ou d’utilisateurs dès la version gratuite
- Modèles: bibliothèque de documents (CGV, CGU, politique de confidentialité etc.)
Principaux inconvénients :
- Fonctionnalités limitées : pas de personnalisation des factures (en version gratuite), pas de version mobile ni d’application
- Intégrations limitées : Moins d’options d’intégration avec d’autres outils ou services tiers.
6. Axonaut
Axonaut est une solution de gestion d’entreprise tout-en-un, pensée pour les TPE et PME qui cherchent à centraliser la gestion de leur activité. En plus de la facturation, Axonaut propose des fonctionnalités de CRM, de gestion de projet, et de comptabilité, permettant aux entreprises de suivre l'ensemble de leur cycle administratif.
Ce logiciel se distingue par son interface intuitive et ses fonctionnalités complètes, qui peuvent être utilisées pour améliorer la gestion des équipes et des ressources internes.

Principales fonctionnalités :
- Facturation, devis, et suivi des paiements.
- Gestion des projets et de l’activité commerciale.
- Outils de CRM intégrés pour la gestion des relations clients.
- Automatisation des tâches administratives.
- Accès mobile pour une gestion à distance.
Principaux inconvénients :
- Solution relativement complexe pour les très petites structures.
- Coût plus élevé que certaines alternatives plus simples.
7. QuickBooks
QuickBooks est l’un des logiciels de comptabilité les plus utilisés au monde, et sa version française offre un ensemble d’outils puissants pour la gestion de la facturation et de la comptabilité des PME. Il permet de créer des devis et factures facilement, tout en offrant un suivi en temps réel des finances de l’entreprise.
Avec ses fonctionnalités de comptabilité avancée, QuickBooks est une solution solide pour les entreprises qui nécessitent un suivi détaillé de leur rentabilité et de leurs transactions.

Principales fonctionnalités :
- Création de factures et devis professionnels.
- Rapprochement bancaire automatique.
- Tableau de bord avec suivi des finances en temps réel.
- Outils de gestion des dépenses et des revenus.
- Intégration avec des applications tierces.
Principaux inconvénients :
- Interface adaptée à un public international, parfois difficile à maîtriser pour des utilisateurs débutants.
- Support client parfois limité en français.
8. EBP
EBP est un logiciel de gestion d’entreprise français très connu, qui propose des solutions de comptabilité et de facturation adaptées aux petites et moyennes entreprises. Il permet de gérer efficacement les devis, factures, et le suivi des paiements tout en offrant une gestion complète de la comptabilité.
EBP est une solution robuste pour les entreprises en croissance qui ont besoin d’une gestion plus professionnelle de leur activité.

Principales fonctionnalités :
- Facturation, devis, et suivi des paiements clients.
- Gestion complète de la comptabilité et de la TVA.
- Outils de gestion des stocks et des achats.
- Interface complète, mais nécessitant un temps d’adaptation.
Principaux inconvénients :
- Peut sembler trop complexe pour les très petites structures.
- Tarification plus élevée que certaines solutions plus simples.
9. Zervant
Zervant est un logiciel de facturation simple, qui permet aux freelances et auto-entrepreneurs de créer des devis et des factures rapidement. Sa version gratuite permet de générer un nombre illimité de factures, ce qui en fait une solution accessible pour les petites entreprises.
Avec sa version premium, Zervant offre des fonctionnalités supplémentaires comme le suivi des paiements et les rappels automatiques pour les factures impayées.

Principales fonctionnalités :
- Création de devis et factures illimités.
- Suivi des paiements et relances manuelles.
- Rapports financiers de base.
- Interface claire et facile à utiliser.
Principaux inconvénients :
- Manque de fonctionnalités avancées pour les entreprises plus complexes.
- Personnalisation des documents assez limitée.
10. Zoho Invoice
Zoho Invoice est un logiciel de facturation en ligne, conçu pour les freelances et petites entreprises. Il offre une solution complète pour créer des devis et factures, tout en permettant une gestion facile des paiements et des relances.
Zoho Invoice se distingue par sa flexibilité et son intégration avec d’autres applications Zoho, ce qui permet d’étendre ses fonctionnalités en fonction des besoins de l’entreprise.

Principales fonctionnalités :
- Création de factures et devis professionnels.
- Suivi des paiements et automatisation des relances.
- Gestion des dépenses et des taxes.
- Application mobile pour gérer la facturation en déplacement.
- Intégration avec d’autres logiciels.
Principaux inconvénients :
- Fonctionnalités avancées accessibles uniquement avec les versions payantes.
- Personnalisation de l'interface assez limitée.